鼻窦炎手术方式主要是鼻内镜下的鼻窦手术。
鼻内镜鼻窦手术是在全身麻醉下进行，在鼻内镜系统的引导下，借助鼻窦手术动力系统或其他手术器械彻底清除鼻腔鼻窦内的病变组织，保护正常鼻腔鼻窦黏膜，同时扩大开放各个鼻窦开口，改善局部引流的一类手术。
术后再结合一段时间的药物治疗，就可以恢复鼻腔鼻窦的正常生理功能。这种手术又称为功能性鼻内镜鼻窦手术，主要针对那些药物治疗效果不佳或鼻腔解剖发育异常的慢性鼻窦炎患者，还有出现鼻息肉或鼻窦炎并发症的患者，是治疗鼻窦炎的必要手段。
此外，针对一些合并哮喘或多次复发的鼻息肉患者，就需要行另一类鼻窦手术，称为鼻内镜下根治性鼻窦手术，手术范围更大，鼻窦开放更彻底，切除组织也更多。
