下丘脑错构瘤如果达到做手术的级别已经属于四级，手术有一定的难度，因此也属于大手术。虽然下丘脑错构瘤并不属于真正的肿瘤，但是可以导致性早熟、痴笑性癫痫或者其他类型的癫痫，长期发展下去还可以导致身材矮小、智力障碍等。使用手术切除错构瘤可以达到良好效果，甚至有可能治愈，所以如果患者条件允许时应尽早行手术治疗。对于性早熟药物治疗无效或者药物治疗有效但是用药物期间发生了共济失调、发作性癫痫等神经系统症状的人群，可使用手术治疗。
