肝门部胆管癌的预后较为复杂，与很多因素有关，治疗相对也有难度，其最主要的原因是肿瘤的复发与转移。肿瘤转移中以淋巴结转移和肝内转移最多见。由于其分化程度低，达到手术切除的要求也相对困难，所以其预后相对较差。因为肝门胆管癌的位置较为特殊，无法像中位胆管癌那样，上下可以展开，也不能如低位胆管癌那样随意切除，高位胆管癌不能切除，就算切除半个肝，也无法根治，只能进行肝脏移植。总的来说肝门胆管癌预后差。患者最好戒烟酒，增加营养，形成良好生活习惯，避免过劳，平时也可适当应用中药汤剂进行综合治疗。
