先天性胆总管囊肿需要做的检查包括CT、B超、肿瘤标记物检查以及核磁共振等。
胆总管囊肿一般是通过B超发现的。由于胆总管囊肿分为五个类型，其中肝外胆管囊肿可以通过核磁共振检查进行观察，并且观察结果较为准确。而CT检查主要用于观测患者的囊肿是否有癌变或其他异常表现。
当先天性胆总管囊肿的表面形状不正常时，需要通过CEA以及CA199等肿瘤标记物检查，确认患者是否有癌变倾向，若有癌变倾向，应及时通过手术切除以及化疗的方式进行治疗，以免症状加重。部分患者进行切除手术时，还需要进行胆道镜检查，以免对手术过程造成影响。
