肛周脓肿切开引流或自行破溃之后，一般会形成肛瘘。但是肛周脓肿和肛瘘属于同一疾病的不同阶段。很多的肛周脓肿未破，也有可能会形成肛瘘，比如高位的肛周脓肿，离肛门皮肤比较远，一般不会从肛周皮肤破溃而形成瘘管。只是在较高较深的位置包裹固定坏死组织及感染病灶，最后形成硬块，而导致肛瘘的形成。脓肿一般是肛周脓肿的急性期表现，可出现红肿热痛。肛瘘则为慢性病程的表现，主要由于破溃引起流脓、皮肤瘙痒等症状，如果引流不畅继发炎症时，则会引起疼痛。
