桥本氏甲减的治疗原则是激素替代疗法，即补充甲状腺激素。
桥本氏甲减表现为甲状腺功能减退，不能为机体提供身体所需的甲状腺素，血清中FT3、FT4、TT3、TT4降低，TSH上升，因此治疗上需要补充外源性甲状腺素，无论是亚临床甲减或者是临床甲减，均可予以补充甲状腺素，可小剂量开始，逐渐加量。
也可根据不同的症状，予以辨证论治，可起到辅助治疗的作用，如肾阳虚衰型的患者，治疗原则为温肾助阳、益气祛寒。脾肾阳虚型的患者，治疗原则为健脾助运、温肾补气。
