胆囊结石的病因相对比较复杂，和多种因素有关，比如饮食因素、性别因素、疾病性因素、医源性因素。在我国西北地区，胆囊结石的发病率较高，这可能和长时间摄入高脂肪食物有关。对女性而言，因为肥胖、妊娠以及雌性激素，都可能会加重胆囊结石的出现几率。各种疾病容易会导致胆囊结石，比如肝硬化、溶血性贫血以及糖尿病等。有一部分人在接受胃肠吻合术，胃部切除手术以及回肠切除手术后，因为生理因素的改变，容易会导致胆囊结石出现，会有疼痛感。
