肺孢子菌肺炎的治疗方法主要包括基础疾病的治疗和病原的治疗。孢子菌肺炎常见于艾滋病、器官移植、放化疗后等免疫力低下的患者,要针对基础病的治疗;病原的治疗,可以选择药物治疗,有一定的疗效;如果出现了缺氧,甚至呼吸窘迫综合征,需要给予氧疗,配合使用糖皮质激素类的药物。患者应该适当的卧床休息,维持正常的生命体征,如果咳嗽、咳痰比较严重,可以适当的使用止咳化痰的药物来治疗,必要的时候可以通过雾化的方式改善症状。