引发后脑勺疼的原因有很多，大致将头痛分为原发性头疼和继发性头疼，原发性头疼指的是良性特发性头疼，即没有什么特殊疾病的头疼，这种情况可以见于偏头疼、紧张性头痛。继发性头疼可以继发于颅内及全身性的疾病，后脑勺疼是由于脑肿瘤和炎症、脱髓鞘疾病、硬膜下血肿、脑出血等等原因导致的。也可以是全身系统性的疾病导致的，比如说高血压病、发烧、各种代谢中毒性的脑病等等。对于任何头疼都需要首先排除继发性头疼，即继发于器质性疾病的头痛。
