新生儿肠炎一般是喂养或者护理不当造成，或者是感染了病毒、细菌，都可能造成不同程度的肠炎。
对于母乳喂养的宝宝，如果妈妈有肠炎症状，比如腹痛、腹泻、发热等。致病因子可以通过乳汁或母亲的接触递给宝宝，此时宝宝就可能出现相同的症状。
对于人工喂养的宝宝，如果奶瓶、奶嘴消毒不合格，或者是剩余的奶液存放时间过长，都可能造成病原菌的污染。宝宝喝了被污染的奶，就可能引发肠炎，造成一系列症状。另外，平日给宝宝洗澡或者睡觉时温度不适当，都可能造成宝宝免疫力降低，此时病原菌就容易入侵，导致呼吸道感染时也常会伴发消化道的症状。
