造成宫外孕的原因有很多，因为绝大部分的宫外孕发生在输卵管部位，宫外孕的发生原因和输卵管异常有很大的关系，比如存在输卵管炎症，因炎症刺激会导致输卵管管腔狭窄、内壁纤毛功能受损，受精卵在输卵管内运行受阻，就会出现受精卵在输卵管内着床的问题。还有就是输卵管自身发育不良或者功能异常，如输卵管自身发育过长、内壁纤毛功能损失等，或者输卵管本身存在囊肿、积液等问题，受精卵无法顺利通过，只能在输卵管内着床。另外，不当的避孕方式，如频繁服用紧急避孕药，可能导致宫外孕发生几率增加。
