胃食管反流的原因有如下几方面：
一、抗反流结构和功能受损：食管下段括约肌静息状态时压力比胃内压力高，起到防止胃内容物逆流进入食管的高压屏障作用。贲门手术后、食管裂孔疝、腹内压升高、长期胃内压升高，导致食管下段括约肌结构受损，某些激素、食物、药物等均可引起食管下括约肌一过性松弛。
二、食管清除作用降低：食管可以通过自身蠕动和唾液中和作用来清除食管内的物质。通过食管蠕动可以清除大约90％的反流物；站立时，食管蠕动依靠重力作用将食物推入胃内消化。干燥综合征患者唾液分泌减少，导致食管蠕动功能下降；睡眠状态下、平躺、食管蠕动减慢、吞咽功能减弱、重力作用下降，导致部分反流物残留在食管内引起食管炎。
三、食管黏膜抗御能力降低：当食管黏膜功能受损时，即使不存在上述两种异常，也可致胃食管反流病的发生。
