一般来说胃镜检查是一种安全性很高的操作，但若指征掌握不严或操作不慎也会引起各类并发症。
1.心脏意外：包括诱发心绞痛、心肌梗死、心律失常及心脏骤停。2.咽喉痉挛以及肺部感染：是由于插镜刺激或误插、误吸等引起。3.麻醉意外：麻醉药物过敏所致。4.消化道穿孔。5.感染。6.出血：可因擦伤、活检等引起。7.咽喉部损伤。8.下颌关节脱臼。9.拔镜困难。10.癔症。做完胃镜检查之后一定要按照医嘱进食，提前喝水进食可能会引起呛咳或者发生吸入性肺炎。检查后有的患者可能出现声音嘶哑，一般休息一周即可恢复。检查后有少数患者可能会出现呕血、黑便等情况，应及时告知医生，进行对症治疗。
