小肾结石可能是由于感染因素所导致的，一般患有泌尿系统感染的患者，有可能会造成尿路内环境发生变化，使一些物质不能溶于尿液当中，就很容易形成结石。
有些患者存在肾盏盏颈狭窄、肾盂输尿管连接部位狭窄、肾囊肿、肾脏肿瘤等疾病后，有可能会对局部尿流动力学造成改变，增加肾脏患有小结石的风险。
在患者患有高钙血症、高尿酸血症后，可能会导致钙盐、尿酸盐在尿液当中的浓度过高，而正常的尿量不能够溶解这些物质，就很容易形成小结石。
患者平时喝水量过少，使尿液浓缩，使尿液当中的一些成分不能够被稀释，也很容易诱发小肾结石。
