根据胃癌切除术后患者的恢复情况，开始化疗的时间也会不同，大多数患者会在术后三周以内开始化疗。通常越早开始化疗，患者的效果越好。
由于原位癌切除手术常会切除胃大部分的组织，必要时还会进行相应的淋巴结的清扫，所以对机体的损伤较大。对于患者耐受力较差、全身状况较差者，往往不宜过早进行化疗，需要等患者的全身状况相对稳定后，才能进行化疗。
但并不是所有胃癌手术后的患者，均需要进行化疗。部分患者处于胃癌的晚期，已经出现重要器官的功能障碍等情况时，往往不宜手术，需要通过姑息疗法来进行治疗。
