无论是哪种性质的胆管瘤，主要以外科手术治疗为主。
胆管瘤有良性和恶性之分，不论是哪种性质，一般多数以发现皮肤黏膜黄染而来院就诊。而对于胆管良性肿瘤的患者来说，出现相应临床症状后，可通过外科手术治疗切除病变部位肿瘤，而后给予断端吻合或胆肠吻合术治疗，以恢复胆道的通畅性，缓解临床症状。
对于胆管恶性肿瘤即胆管癌的患者来说，其典型的症状为无痛性进行性黄疸加重。如果在符合手术适应症的前提下，需要进行胰十二指肠切除术，并结合术后具体的情况，必要时行辅助化疗。
如果已经无法进行手术切除治疗，则可以行内引流或外引流，减轻黄疸症状，主要以避免病情快速恶化，导致肝功能衰竭等情况为主。
