胃底贲门肿瘤通常情况下，其治疗方法是进行外科手术切除。
对于胃底贲门肿瘤可以分为良性肿瘤和恶性肿瘤。但是无论是哪种性质的胃底贲门肿瘤，由于随着时间的发展、肿瘤的增大，可出现堵塞贲门造成吞咽困难或者是时间过长后良性病变继发恶变的可能。
所以，为避免上述情况的出现，临床一旦发现后，建议积极给予手术治疗。
但是，对于一些病变较小，性质明确的良性肿瘤，如果患者排斥手术治疗的话，可以行内镜下治疗或局部切除，从而减少手术对患者的创伤。
而如果确诊为恶性的话，则必须行外科根治性手术治疗。
