脑囊肿的主要治疗方法包括药物治疗和外科手术治疗。
大多数的脑囊肿都由先天性因素引起，也有少部分是因为外伤和感染因素引起，因此如果脑囊肿与感染有关，可以服用抗感染的药物治疗，但是这种方法的治疗效果往往不太明显。
只不过大部分的脑囊肿并不存在明显的症状，一般不用特殊治疗，可以定期去医院随访观察即可。而如果脑囊肿明显增大，对周围组织造成了压迫，并且患者出现了头痛头昏，癫痫以及视力下降等典型症状，则需要及时采取外科手术治疗。
