通常情况下，新生儿颅内出血的后遗症主要是脑瘫、智力发育低下、生长发育落后、行为异常、癫痫等，但是具体与出血量以及出血部位等有很大的关系。
一般情况下出血量比较少，而且没有压迫脑组织的情况下，就可能不会留下后遗症。但是如果是出血量比较多，尤其是脑组织以及脑室内出血，大部分就可能会出现神经系统不可逆的损害，从而出现脑性瘫痪、发育落后，甚至智力低下、意识障碍等。出血部位发生纤维化，形成异常兴奋灶还可能导致癫痫的后遗症。
新生儿颅内出血建议尽早进行干预处理，降低发生后遗症的概率。
