甲状腺功能减退的治疗方法主要是选择药物进行治疗，通过口服甲状腺激素类的药物，可以使激素水平恢复正常，有些患者还可能需要终身药物治疗，造成甲减的原因不同，具体的治疗也会有所差异。
对于患有甲状腺功能减退的患者，有时会出现较为危重的症状，比如：甲减造成黏液性水肿昏迷时，在治疗的时候，一定要去除诱发因素，及时补充甲状腺激素，而且还需要选择糖皮质激素类药物治疗，必要时进行补液，对症治疗。
如果患者的甲状腺功能减退时是由于服用某些药物导致的，首先需要停止使用这些毒害甲状腺功能的药物。
如果是由于碘缺乏所引起的甲状腺功能减退，需要给予足量的碘治疗，使甲状腺功能恢复正常。
