小儿慢性咳嗽的治疗首先是寻找病因，然后针对病因进行干预处理。
- 小儿慢性咳嗽建议尽早进行胸片、血常规、C-反应蛋白等检查，了解有无感染存在。同时，建议积极进行痰培养寻找致病菌，然后尽早进行有效的抗感染药物治疗，可以适当服用止咳的药物进行治疗，改善症状。
- 如果慢性咳嗽呈反复发作，而且是有过敏病史或者是哮喘家族史的情况下，就建议尽早进行肺功能、过敏原等检查，考虑支气管哮喘可能，建议急性期雾化吸入支气管扩张剂控制症状。稳定期建议长期规律吸入支气管扩张剂以及糖皮质激素长期控制症状，必要时可口服抗白三烯抗体的药物降低气道高反应。
