纵隔肿瘤手术风险的大小主要和肿瘤生长的部位、大小、对周围重要组织是否有侵犯等等因素有关。
如果肿瘤已经与周围器官组织发生明显的压迫、粘连、浸润，做手术时风险会很大。尤其是肿瘤包绕着大血管，可能需要进行体外循环，把受累的血管切除掉，再换上人工血管，这样的手术风险很大。
但是有的部位的实性结节，跟周围组织没有明显关系，这种手术非常简单，一般采用胸腔镜手术可以很快完成。
复杂纵隔肿瘤手术有风险，术后可能造成纵隔损伤、肺部的损伤、神经受损、肿瘤切除以后复发等可能。
