孕妇体温过高、出现了盆腔感染或宫内感染、有出血性倾向或凝血功能障碍疾病等不能做羊水穿刺检查。
如果患者出现体温过高、盆腔感染或宫内感染的情况下，做羊水穿刺检查容易导致胎儿在宫内感染，可能导致流产。另外，羊水穿刺检查为一项有创检查，如果患者有出血性倾向或凝血功能障碍疾病，做此项检查容易导致孕妇出血不止，最终引起失血过多，危及胎儿及母亲的生命。
羊水穿刺检查适用于高龄孕妇、夫妻双方任何一方染色体异常或其携带者，或产检时NT过高等胎儿有高危遗传病倾向的孕妇，是需要通过做羊水穿刺检查为胎儿做染色体核型分析，从而判断胎儿是否有遗传性疾病。
