男性尿路感染反复发作的原因有多种可能性，主要有以下几种原因：
1、泌尿系统存在病理性因素：一是泌尿道的结构问题：如泌尿系统存在畸形，肾盂输尿管连接部存在狭窄、尿道存在憩室；二是泌尿道有结石：结石未排出，容易引起泌尿系统反复感染。
2、全身疾病：一些能引起免疫力下降的疾病可导致全身免疫系统遭受破坏而引起反复尿路感染，如艾滋病等。
3、特殊的病原菌：如结核杆菌引起的泌尿系统感染常表现为反复发作，若发现为泌尿系统结核感染，需及时进行抗结核治疗。
