引起扁桃体肿的常见疾病是炎症性疾病，比如急性扁桃体炎和慢性扁桃体炎。急性扁桃体炎患者除了会出现扁桃体肿以外，还会伴随咳嗽、咳痰、发热、乏力等不适症状，而导致急性扁桃体炎的主要原因是细菌或病毒感染，以及烟雾、粉尘、高温、化学气体刺激等。慢性扁桃体炎患者的临床症状主要是为痰多、咽部有异物感，通常在身体过于疲劳、着凉、感冒、过度饮酒、大量抽烟后发病。
除此以外，扁桃体肿瘤、扁桃体结石等疾病，也会引起扁桃体肿痛。
