由于透析是血液需要从自身引流进入到体外管道和机器，一方面透析机的使用可能减少进入体外循环的血液中的抗凝物质；另一方面血液在于人工管道接触的过程中可能会激发凝血机制，从而发生凝血，堵塞管道，故需要使用抗凝剂来防止这一情况的发生。
临床上使用最多的抗凝剂有：肝素、低分子肝素、以及新型抗凝药，需要注意的是在使用传统抗凝剂是需要密切监测患者的INR值，预防大出血的可能。患者使用抗凝剂后，若出现牙龈出血、鼻出血等症状，需考虑减少或停止使用抗凝剂。
