心肌酶高提示心肌缺血或心肌坏死，临床治疗需要根据升高的程度和引发的原因，针对原发疾病进行药物治疗或生活干预以降低心肌酶。若由生理性因素导致心肌酶水平异常，可慢慢自然恢复。
若是心肌酶升高怀疑由疾病引起，需要明确具体病因，针对原发病进行治疗。当原发疾病受到控制，后心肌酶也会随之降低。如病毒性心肌炎引起心肌酶升高时，通常选用营养心肌的药物进行治疗。冠心病引起心肌酶升高时，急性心肌梗死的患者发作时进行急救，立即选择介入治疗或溶栓治疗，控制心肌坏死的范围，病情稳定后进行相应的药物控制病情发展，心肌酶随之降低。
因此要选择适合的方法治疗原发疾病，使心肌酶降低。
