子宫内膜异位症可以导致女性不孕。如果女性子宫内膜异位到子宫肌层，引起子宫腺肌症，就会引起子宫壁变厚，影响受精卵着床，导致女性不容易怀孕。即使受精卵着床成功后，也比较容易引起流产或者早产等现象。如果子宫内膜异位到卵巢，引起卵巢巧克力囊肿后，一方面会引起女性出现明显痛经。另一方面，随着囊肿逐渐长大，就会影响卵巢功能，导致内分泌失调，影响卵泡发育。如果卵巢中没有优势卵泡发育成熟排出卵子，就会导致女性出现不孕。同时，盆腔子宫内膜异位症还会影响盆腔的微环境，也对顺利的妊娠有不利影响。
