不同类型鼻窦炎治疗效果也不同。
急性鼻窦炎可应用鼻用糖皮质激素，短期使用鼻用减充血剂，应用生理盐水、激素、抗生素药物行鼻腔冲洗。全身炎症控制后可行上颌窦穿刺术，一般通过积极治疗，可达到较好的治疗效果。
真菌性鼻窦炎可采用手术治疗，特别是真菌球类鼻窦炎，经手术治疗后效果确切，多数可治愈。
不伴鼻息肉的鼻窦炎可先应用药物治疗，如抗生素、鼻喷剂、中成药，如果保守治疗效果差，可手术治疗。术后定期随访、坚持综合药物治疗，一般疗效较好。伴鼻息肉的鼻窦炎需先药物治疗，并行手术治疗，术后应坚持使用鼻用糖皮质激素，并定期复查，否则治疗效果差，容易复发。
