诊断往往需要与患者典型的临床症状、神经系统的检查以及特异性的脑脊液等相关的生化检查结合，才能确诊脑炎。临床表现的症状与病毒侵袭的脑组织部位、侵犯的严重程度有密切关系，临床可表现为多种多样，典型症状有抽搐、发热、头痛、呕吐等。一般是建议行神经系统检查的，可有脑膜刺激征阳性，例如布氏征阳性等等。另外，需要做脑脊液穿刺等检查方可确诊，不同类型脑炎化验检查结果不同，病毒性脑炎的脑脊液，可表现外观清亮，细胞数是不高，淋巴细胞为主等特性，化脓性脑炎脑脊液表现为外观混浊样，检查可有化脓性细菌。
