三个月的宝宝咳嗽、有痰的处理措施需根据个体情况而定。如果与咽喉部炎症或者支气管炎、肺炎等疾病有关，确诊后可以在医生的指导下，给孩子应用副作用比较小的头孢或者青霉素类的消炎药物，以及有止咳化痰作用的药物进行治疗。三个月的宝宝通常不太会咳痰，如果痰液黏稠咳不出来，可以给孩子进行雾化吸入，有很好的稀释痰液、促进痰液咳出的作用。如果宝宝伴有明显的打喷嚏、流鼻涕等上呼吸道感染的症状，也可以配合用一些对症的药物。日常护理时要经常给孩子拍背，让孩子侧卧睡眠，防止痰液堵塞气道引起窒息。
