严格来说慢性扁桃体炎的传染性很小，可以忽略不计。慢性扁桃体炎病情稳定期炎症会潜伏在扁桃体黏膜内，黏膜内会含有多个炎性细胞浸润，病原体的含量较少，所以病原体不容易随患者分泌物排出体外引发传染。但是，慢性扁桃体炎急性发作期间，患者口腔、喉腔内的分泌物中会含有大量的细菌、病毒等微生物，这些微生物会随着患者咳嗽、咳痰被排出体外。排出体外的微生物如果被健康人接触，有可能会引发传染，可能会增加各种上呼吸道感染性疾病的发病率。但是因为受传染者的个人体质不同，所以发生传染后受传染者的发病几率因人而异。
