自身免疫性脑炎根据不同情况，治疗时间不同，一般时间为6周左右。
自身免疫性脑炎也属于自身免疫性疾病，主要与自身免疫反应有关。在现代医疗条件下，通过脑脊液、磁共振、脑电图、抗神经抗体等检查，诊断不难。诊断后根据疾病临床分型、个体患病轻重程度以及个体对药物敏感性，选择合理的治疗方案，包括免疫治疗，控制癫痫发作，康复治疗，对症支持治疗，来控制病情进展，一般需要6周左右的治疗时间。
对于复发性的自身免疫性脑炎，可能由于个体自身免疫反应活跃或者对药物反应性差，治疗时间会比较长，需要长时间免疫治疗。对于合并肿瘤的自身免疫性脑炎，针对肿瘤的治疗时间也会比较长。
