甲亢可能引起多种并发症。最常见的一种并发症为眼睛凸出，严重时会出现两侧眼睛不对称凸起，同时会有怕光、结膜炎反复发作等症状，最后会发展成眼睛不能闭合、看东西重影子等严重的眼部并发症，恶性突眼可能会导致患者在甲亢治好了以后也不能恢复原状。甲亢作用于心脏可能导致甲亢型心脏病，心率加快，严重时可造成心力衰竭；甲亢作用于腓骨会引起腓骨的黏液性水肿。若甲亢长期不治疗，可能会造成甲亢危象，会伴随心跳过快，呼吸过快，全身的高热，同时会伴随水电解质的紊乱等，严重时会危及患者生命。
