噬血细胞综合征的寿命长短与病因、疾病严重程度以及治疗情况有关系。一般情况下，家族性噬血细胞综合征不进行治疗，患者大约存活2-3个月。积极进行化疗后最长可以存活10年左右，但是具有很大的个体差异。继发性噬血细胞综合征预后相对比较好，如果是细菌感染导致，通过对原发疾病进行治疗，可以存活很长时间，甚至对寿命没有影响。但是如果是EB病毒感染导致，死亡率可达60%以上，存活时间几个月到几年不等。但是部分患者也可以长期存活。平时需要加强护理，降低发生感染的概率。
