肠结核与克罗恩病鉴别可从以下几个方面进行判断，
首先肠结核一般无外在表现，而克罗恩病多表现为口腔溃疡，关节红肿。
其次，病理检查状态不同，肠结核其病理组织呈横行，且表皮不规则，而克罗恩病组织呈纵行裂隙状。最后就是肠结核病理组织含有干酪样肉芽肿，而克罗恩病没有。
因为两者症状有时比较相似，所以在临床中也容易产生误诊。但它两是完全不同的病症，其病理性质不一样，所以治疗也不同。
因此，无论肠结核患者还是克罗恩病患者，在治疗前都要做一个明确的分析确诊，这样后续治疗才有针对性。
