脚指头疼痛的原因有很多，具体如下：
1、甲沟炎：发生在脚趾甲的两侧，主要是由于炎症感染引起的，由于脚趾甲向两侧组织中生长，所以导致软组织出现炎症感染，表现为红肿、硬结，患者疼痛非常明显。大多数需要在医生的指导下口服抗生素类药物治疗，然后再根据炎症的情况，决定下一步的治疗。
2、痛风：痛风的特点是常累及到大拇指，尤其是在夜间大拇指严重疼痛，有时患者会痛醒。口服非甾体类消炎药进行止痛处理，在疼痛消失后再使用降低尿酸类的药物进行治疗。
