合格的痰标本的采集是需要经过规范的操作和途径而达到的。如果取痰标本时受到周围环境或者操作手段不当时，则会影响痰标本的检测结果。临床上取痰标本时，通常以晨痰为佳，采集前要嘱患者清水漱口或刷牙清洁口腔，尽可能在未使用药物前采集标本，取患者呼吸道深部的痰。对于难于自然咳痰的患者可借助吸痰管抽取。合格的痰标本对判断呼吸道感染的原因是有重要意义的，因此，在临床上要尽量操作规范，采取标本后要置于无菌干燥的容器内，并及时送检。
