需要根据肺脓肿的病因来进行鉴别。第一个是吸入性肺脓肿，通常是由酗酒、脑血管意外、药物服用过量、麻醉过程中造成的误吸等导致病原微生物进入肺部，引起的不同程度的感染。第二个就是有继发性的肺脓肿，这类患者长期有炎症症状，且本身有肺部基础疾病，如支气管扩张、支气管囊肿、肺癌，或者结核性肺空洞，造成合并性肺部感染时，继发了肺脓肿。第三个就是血行性的肺脓肿，这类患者通常局部感染的情况，最常见的如皮肤的疖、痈，挤压以后导致细菌随血液到达肺部，引起肺部化脓性的炎症。
