引起卵巢囊肿的原因主要有两种，具体如下：
1、生理性的，主要包括卵泡囊肿和黄体囊肿，这两者都是由于卵泡的排出导致的。卵泡囊肿是由于卵泡未成熟或者没有排出而发生的，黄体囊肿是卵泡在排出之后产生的黄体形成的。
2、病理性的，主要包括卵巢子宫内膜异位囊肿、卵巢囊腺瘤以及卵巢皮样囊肿，其中最常见的是卵巢子宫内膜异位囊肿。卵巢子宫内膜异位囊肿目前认为主要与经血逆流有关，逆流的经血将子宫内膜种植到其他部位，种植到卵巢部位可以形成囊肿，变成卵巢子宫内膜异位囊肿。
