宫颈癌疫苗九价和四价的区别主要在于针对的HPV病毒的种类以及接种人群。宫颈癌疫苗四价主要是针对4种HPV高危病毒，具体包括6、11、16以及18型HPV病毒，宫颈癌疫苗九价主要针对9种HPV高危病毒，除了四价疫苗包含的4种之外，又增加了5种。另外，宫颈癌疫苗九价和四价规定的接种人群不一样，宫颈癌疫苗四价将年龄规定在20到45岁，而宫颈癌疫苗九价的接种年龄为9到26岁。在接种任何一种宫颈癌疫苗之前，都需要向接种医生询问自身状况是否适合。
