胚胎停育的原因主要有以下几点：1、精子或卵子的质量不佳或是细胞分裂异常，这种情况导致的胚胎停育是偶然发生的，没有办法阻止。2、夫妻染色体异常，这是导致胚胎停育的重要遗传因素，包括染色体易位、嵌合体、缺失和倒位等。3、内分泌因素，主要包括黄体功能不全、黄体期子宫内膜反应低下等，胚胎没有获得足够的孕激素，导致胚胎停育。4、感染因素，主要包括细菌感染、沙眼衣原体、弓形虫感染等。5、其它因素，主要包括运动过度、应激、减肥、慢性消耗性疾病、营养不良、精神心理因素、吸烟饮酒、环境毒性物质等。
