胚胎发育不良的原因主要有以下几种：1、先天性的原因，主要包括精子或卵子的质量不佳、夫妻染色体异常等。2、孕激素不足，孕妇黄体功能不全或黄体期子宫内膜反应低下，导致卵巢黄体产生孕酮不足以及子宫内膜的孕激素敏感性下降，胚胎无法得到足够的孕激素支持。3、感染因素，包括细菌感染、沙眼衣原体、弓形虫感染等。4、其它因素，包括慢性消耗性疾病、营养不良、精神心理因素、吸烟饮酒、环境、运动过度、应激、减重等。
