卵泡萎缩是卵泡发育不良的一种，卵泡萎缩通常是由于多囊卵巢综合征、中枢神经系统异常、下丘脑异常、内分泌系统失调等因素导致排卵障碍，卵泡排不出而导致萎缩。
一些全身性疾病如重度营养不良也可影响卵巢功能的调节而导致排卵障碍，卵泡排不出而导致萎缩。其中主要原因是雌激素水平上不去，内膜增厚也提示激素水平的问题。
如果检查卵泡不能排出而萎缩，应该做内分泌检查寻找原因，然后根据病因进行治疗。
