随着卵巢囊肿的性质、大小不同，对应的治疗方式也不尽相同。如果初次发现囊肿不大的话，查相应的肿瘤指标，没异常的话，可以两个月后复查排除生理性的囊肿。有些囊肿太小的，可以选择不做特殊治疗。一般来说，如果囊肿直径小于5厘米，没有证据提示肿瘤的话，多为功能性囊肿，可以服用药物治疗，密切随访，定期复查观察囊肿变化；如果囊肿直径大于5厘米且持续存在，则多为卵巢肿瘤，一般需要手术治疗。
