孕酮是卵巢在排卵的时候所分泌的一种激素，因此如果孕酮的水平比较低，
首先考虑有可能是黄体功能不全、卵巢发育不良等原因而引起。另外，如果曾经受过一些伤害，比如出现过先兆流产、早产、闭经、宫外孕等情况，孕酮的数值也会比较低。如果存在一些全身性的疾病，比如甲状腺功能失调、胰岛素抵抗等，也可能造成孕酮偏低。
另外，生理性情况下，卵泡期的孕酮以及绝经后的孕酮水平都是比较低的。
