移植后的胚胎会四处游走寻找合适的着床位置，倘若宫腔内的环境不适合胚胎生存、发育，那么胚胎有可能会在宫腔外安家，宫外孕就此发生。一般腹痛会在怀孕5-6周左右时发生。女性在行胚胎移植后，若测得尿HCG阳性， 应定期复查血HCG、孕酮、B超等。若出现阴道流血、腹痛等症状时（尤其有过宫外孕病史的患者），应立即去医院就诊，及时行妇科B超以排除宫外孕的可能。确诊宫外孕后，应及时住院用药观察以免发生宫外孕破裂。
