造成孕晚期羊水混浊的最常见的原因为胎儿宫内缺氧，导致迷走神经兴奋，肛门括约肌松弛，胎儿排便到羊水中，导致羊水污染引起胎儿宫内缺氧的原因又包括：妊娠期高血压、妊娠期糖尿病控制不佳，胎盘功能异常，脐带扭转等。
造成羊水混浊的原因还包括：
1、胎儿发育异常；
2、羊膜囊内的感染。正常的羊水无色无味，里面含有白色粘腻的胎脂，应与羊水污染做区分。
