子宫腺肌病病因至今不明。目前的共识是基底层子宫内膜侵入基层生长所致，多次妊娠与分娩、人工流产、慢性子宫内膜炎等造成子宫内膜基底层损伤，与腺肌症发病密切相关。另外，高水平雌孕激素刺激也可能是促进内膜向基层生长的原因之一。做剖腹产手术或者刮宫手术、子宫肌瘤切除手术时，都可导致子宫肌层损伤，如果子宫内膜恰好进入局部没有清理干净，就会形成子宫腺肌病。
