本病主要采用外用药物治疗。外用药物治疗适用于皮损较大或不宜用物理治疗者，但应根据不同情况选择药物及使用方法。
常用药物包括：1、0.05％～0.
1％维A酸软膏或阿达帕林霜，适用于扁平疣；2、
5-氟尿嘧啶软膏外用，因可遗留色素沉着，故面部慎用；3、
3％酞丁胺霜或
3％酞丁胺二甲基亚砜外用；
4、平阳霉素、
1％普鲁卡因稀释后于疣体根部注射，适用于难治性寻常疣和跖疣。另外冷冻、电灼和激光等，适用于皮损数目较少者。
